政府采购过程中，质疑比较多，但许多质疑是源于供应商对政府采购制度的误解。如不少供应商认为，政府采购就是最低价中标，遇到其最低价不中标时就要质疑。实际上，在政府采购中，并没有最低价必然中标一说。即使是一些简单、标准的货物采购，也是采用最低评标价法，但最低评标价法显然不等于最低价评标法。对信息系统项目而言，我们经常采用的评标办法是综合评分法和性价比法。譬如，以下几例，责任根本在供应商，但他们却跑到采购中心质疑。
案例一：2002年，某多媒体教室集成项目（13套100座交互式教室），共27家有效投标人，最高报价529万元、最低报价145万元、算术平均价271万元，中标供应商投标价为257万元。结果公示后，报价最低的投标人马上质疑，报价最低为何不中标？仔细分析后集中采购机构发现，之所以报价低主要是由于该供应商所提供设备档次太低，因为不同品牌、不同档次的同类设备，价格相差悬殊。收到质疑答复后，该供应商仍不服，进而投诉。政府采购监督管理部门再次邀请专家进行复审，专家一致认为，该供应商所提供设备的质量、性能都较差，无法确保正常的教学需求。
案例二：2004年初，某应用系统（含软件、硬件和集成）项目招标过程中，共有7家有效投标人，最高报价5100万元、最低报价2600万元、算术平均价3973万元，中标供应商投标价为4100万元，结果公示后，报价最低的投标人提出质疑。但经调查发现，该供应商报价低主要是由于缺少大量产品以及少数量造成的，不知这些错误是无意的，还是有意为之。也就是说，其低报价是靠少提供或不提供所需设备实现的，将缺少的设备按相应价格计算后，可以发现，其报价高于中标供应商的投标价。
案例三：2004年底，在某存储设备和办公自动化系统项目招标过程中，共有8家有效投标人，最高报价320万元、最低报价230万元、算术平均价276万元，最终中标人的投标价为255万元。结果公示后，报价最低的投标人提出质疑。但查阅当时专家评审意见可知，评审专家否定该供应商的主要理由是他没有任何方案，只是设备报价罗列。对系统集成项目，若没有必要的方案设计和详细的描述，报价再低，估计也不会中标，因为这是系统集成项目（方案是体现水平的地方），而不是简单设备招标。
其实，集中采购机构不仅不反对供应商进行质疑，而且还欢迎有理有据的质疑，以推动工作的改进。只是希望供应商在质疑前，一定先找一下自己的原因，以免浪费人力、物力。另外，供应商在投标时要认真研读招标文件，区别对待不同项目，因为不同的项目有不同的要求，如设备招标与系统集成招标，其要求肯定不同。对系统集成项目，报价只是评标的依据之一，其他诸如方案设计、设备选型、设备质量、性能、数量等等，都是评标时必须考虑的因素。这些因素，对投标供应商来说也是相当重要的。
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